三萬大軍開始起拔，向長安進發，但正如醫師所言，疫病有潛伏期，一路之上，陸陸續續有侍衛倒下，開始有官員也倒下了。
大軍抵達西城郡石泉縣時，忽然傳來消息，皇幼子趙王楊杲病倒，這個消息如晴天霹靂，趙王楊杲是楊廣最小的兒子，年僅十歲，被楊廣視若珍寶，楊廣遲遲不立皇太孫，實際就在考慮將來立楊杲為太子。
不過楊杲畢竟也不是嫡子，楊廣也顧忌蕭皇后和晉王的感受，便暫時不提此事。
楊廣連忙趕去探望兒子，只見幼子楊杲躺在病榻上，面如金紙，雙目緊閉，已經奄奄一息。
楊廣心如刀絞，眼淚都流下來了，這是他最心愛的兒子，竟然也染疫病了。
醫正張愷連忙低聲勸道：“陛下，趙王殿下正是傳染極強之時，這里不安全。”
楊廣只得走出房間，傷心問道：“朕的皇兒能救活嗎？”
“病情發現得及時，或許還有希望，微臣會盡全力救治，但趙王殿下不能再走了，會惡化他的病情，把他留在石泉縣靜養吧！”
楊廣萬般無奈，只得點點頭，轉身回去了。
隊伍繼續出發，這天開始進入子午谷，不料剛進子午谷僅數十里，天子楊廣也發病了。
這個消息讓百官都驚呆了，虞世基、王隆和樊子蓋三人緊急商議。
“天子好好的怎么會感染疫病？究竟是哪里出了問題？”樊子蓋不解問道。
王隆沉聲道：“我問過張醫正，張醫正說，是天子身邊的兩名宦官感染疫病，他們二人曾經幾次替天子去探望趙王的病情，應該是那時被感染，他們二人發病后隱瞞了病情，便把天子也感染了。”
樊子蓋咬牙道：“發病了還隱瞞病情，真是該死！”
虞世基憂心忡忡道：“我擔心的是天子救不活怎么辦？趙王在石泉縣生死不明，要么就擁立洛陽皇長孫，或者擁立晉王？”
王隆搖搖頭，“現在不能考慮那么多，先全力救治天子吧！”
隊伍在子午谷內的一片寬闊處停下，王隆找到了醫正張愷，將一袋藥遞給他，“加大劑量，今晚就要見分曉！”
張愷接過藥，匆匆走了
入夜，天子楊廣虛弱地坐在帳內流淚，他已得到消息，最心愛的幼子已經病亡，只是下面人不敢告訴自己。
此時楊廣幾乎崩潰了，他現在無比思念妻子蕭氏，恨不得插翅飛回洛陽，雖然還有十幾萬大軍在劍閣以北的義成郡和巴西郡，但他已經不放在心上了。
“陛下，該吃藥了！”
天子楊廣最信任的司宮魏氏出現在身后，手中端著濃濃的一碗藥。
“朕已經不再腹瀉，這藥就不用再喝了吧！”
“陛下，疫病哪有這么容易好的，很容易反復，這個時候更要加大藥量。”
楊廣點點頭，“你說得對，需要斬盡殺絕才不會反復，朕就是心太軟，不過這藥太難喝了。”
“陛下，我放了陛下最喜歡的蜂蜜，應該好喝很多。”
楊廣嘗了嘗，果然有蜂蜜，是他喜歡的滋味，他便在司宮魏氏的精心服侍下，喝下了一大碗湯藥。
但很快楊廣便腹痛如刀割，腹瀉不止，最后拉出血也停不住，一更時分，天子楊廣因為失血太多，最終不治，不幸溘然長逝。
魏氏急忙派人通知宇文化及，宇文化及當即命令心腹手下裴虔通、薛世良二人封鎖王帳，并以救治不力為借口，殺掉了所有御醫，包括醫正張愷和司宮魏氏也被裴虔通砍掉了腦袋，這兩人的一場富貴夢嘎然而止。
宇文化及又命令虎賁郎將司馬德戡、趙行樞二人各率一萬軍隊前后封鎖子午谷，防止消息泄露，只有獨孤懷恩和李孝常二人被準許騎馬北上。
百官聽說天子染病不治，已經在半夜去世，都伏地大哭。
近百名大臣都聚集在大帳內商議，大隋不可一日無君，天子既然病亡，大家就要考慮立新君了。
但意見都不一致，有人的主張立洛陽皇長孫，有的主張立長安的皇三孫，但也有不少主張擁立晉王。
就在這時，宇文化及率領數百披甲侍衛沖了進來，宇文化及提槊厲聲道：“南面還有十幾萬大軍，你們就不管他們的死活嗎？”
虞世基上前道：“立新君比軍隊更重要，孰重孰輕我們更清楚，不需要宇文將軍來安排！”
“放你的狗屁！”
宇文化及一槊刺穿了虞世基的胸膛，虞世基措不及防，慘叫一聲，當場斃命。
樊子蓋大怒，指著宇文化及大罵道：“奸賊敢殺大臣！”
宇文化及給身后的鷹揚郎將孟秉使個眼色，孟秉揮大刀劈向樊子蓋，‘噗！’樊子蓋人頭被劈飛，鮮血染滿了大帳。
大帳內頓時鴉雀無聲，所有官員都被嚇壞了，王隆上前假惺惺道：“一切由宇文大將軍做主！”
宇文化及冷笑一聲道：“你現在才知道讓我做主嗎？”
他舉槊以掩耳不及迅雷之勢一槊刺穿了王隆的胸膛，王隆瞪大了眼睛，他手指宇文化及，“你你.”
王隆不可思議地看著宇文化及，只見宇文化及嘴角露出一絲獰笑，王隆這時終于明白了，自己與虎謀皮，最終被虎所噬，“啊！”他不甘心地慘叫一聲，倒地而死，卻死不瞑目。
宇文化及舉起一份密旨高聲道：“傳天子遺旨，大將軍宇文化及忠君愛國，封內史令右丞相，統領三軍攻滅西隋，并領導百官重立皇嗣。”
宇文化及厲聲問道：“這是天子遺旨，誰還有異議？”
眾人望著慘死的三名相國，尤其被砍掉了腦袋的樊子蓋尸體，更是讓人膽寒，只得紛紛答應，“一切由宇文相國做主！”
宇文化及點點頭，“我們要繼承天子遺志，攻滅西隋叛逆，然后我再和大家商議立新君之事。”
宇文化及以染病為借口，下令將天子楊廣身邊的宮女宦官全部殺死，尸體放火燒成灰后深埋。
雖然百官都不愿意燒毀天子尸體，可一想到天子已經成了瘟疫源頭，不燒掉大家都會倒霉，也只得認了。
宇文化及假惺惺把天子骨殖裝進一口銅棺內暫時掩埋，等后來送回長安安葬，這才稍微安慰了百官，好歹天子遺骨還在。
宇文化及這才率領三萬大軍帶著百官南下，前往義成郡。
陳棱奉命率三萬大軍攻打葭萌關，天子后來又給他追加了兩萬軍隊，追加的軍隊由虎賁郎將趙優統領，趙優原本是襄陽郡通守，他是關隴八柱國之一趙貴的后人，也是元家女婿。
在王隆的安排下，趙優和陳棱合兵一處，也順利成章地成為陳棱的副將。
這時，陳棱也得到消息，南鄭縣出現了疫情，他也連忙停止攻打關隘，等待天子消息。
這天上午，一名宣旨官趕來，向陳棱宣旨，要求陳棱立刻去面圣，匯報軍情，軍隊暫時交給副將趙優。
陳棱接下圣旨問道：“聽說南鄭那邊爆發疫情，現在情況如何了？”
宣旨官嘆口氣道：“疫情確實很嚴重，天子已經移駕到石泉縣，我是繞過南鄭縣過來的，南鄭縣現在的慘相我也不知。”
陳棱沒有懷疑，便把軍權暫時交給副將趙優，這才跟隨宣旨官前往石泉縣。