丁雨生革職以后，為擺脫生活困境，浪跡九江、上海、揚州，甚至溯運河北上安徽、山東，四處尋找職業，盡皆碰壁，最后決心回故鄉，再過郎中生活。當回程至九江時，見大江南北人才薈萃。原來是兩江總督曾伯函在此招攬各方人才，欲圖與長毛亂軍抗衡。丁雨生大喜，即尋一旅館住下，根據自己這幾個月流浪生涯中對長毛亂軍的考察了解，著意制訂了一份進軍安慶的方略，然后到總督衙門投呈。時曾伯函正思進取安慶，見丁雨生呈文計劃周詳，別有見解，不禁心喜，即召丁雨生晉見。丁雨生侃侃而談，對長毛亂軍軍力和長江沿線布防情況進行了詳細的分析。曾伯函見丁雨生諸事留心，思維周密，不知他文才如何，便又邀入公館花園散步。詢問惠嘉潮各地風土民情后，兩人來到一株燦放的梅花樹邊。曾伯函指著梅花道：“丁縣令能否以此為題，作詩一首？”丁雨生道：“勉力為之。”略作思考后，落筆寫道：“江南一樹梅花發，一樹梅花發石巖；花發石巖流水響，石巖流水響潺潺。潺潺滴滴云煙起，滴滴云煙起半山；煙起半山春汛到，半山春汛到江南。”曾伯函看后贊道：“詩絕妙，書法亦上佳。”當日，曾伯函即委丁雨生為九江關卡卡員，并奏請朝廷，于大乾彤郅元年（9062十一月開復了丁雨生原來的官職。嗣后不久，丁雨生到廣東會辦厘務，曾伯函贊為“廉正明干”、“才識宏遠”。彤郅二年三月，兩廣總督毛鴻賓委派丁雨生到廣東高州縣督辦火器。丁雨生請同鄉黃達權翻譯《火器略說》和繪制制作圖案，在廣州市郊燕塘設立制炮局，很即制出火炮36尊，炮2000多發。這些軍火運到安徽為淮軍使用，幫了淮軍將領李紹泉的大忙。
彤郅三年五月，江蘇巡撫李紹泉奏調丁雨生到上海籌辦洋務。丁雨生甫到上海，便協助李紹泉解決了“常勝軍”裁撤問題，“常勝軍”按期裁遣后，李紹泉對丁雨生的能力備加贊賞，并上奏朝廷，委丁雨生為蘇、淞、太道，并要他創辦江南機器制造總局。丁雨生買下美商旗記鐵廠，合并上海、蘇州兩個制炮局，順利創建了當時中土最大的槍炮廠——江南機器制造總局，再次顯示了過人的能力。
彤郅六年夏秋之交，江蘇境內風雨大作，清水河洪水滔滔滾滾，沖決了堤壩，淹沒了大量田莊。時丁雨生在兩淮鹽運使任上，受江蘇巡撫李紹泉委任前往治理。沿途只見生靈涂炭，哀鴻遍野。丁雨生心急如焚，行裝甫卸即率各級官吏督修堤壩，并親自擔石填堤。然而，在湍急的洪流中，投下的石塊泥沙多被沖走，收效甚微。丁雨生眉頭緊鎖，苦苦思索，想到一法，叫人砍來大批青竹，編成一個個肚大口小的籮筐，然后將沙石裝入其中，再加投擲。此舉果然奏效，不旬日間，堵住了決口。而后，丁雨生督率民役，晝夜奮戰，筑起了堅固的堤壩。后來，當地群眾稱這道堤為“丁公堤”，紀念丁雨生的功績。
彤郅六年十二月，丁雨生升任江蘇巡撫。當時官場多為貪婪庸碌者充斥，吏治一片黑暗。丁雨生為自勉及訓誡各級官吏，作一楹聯貼于撫衙朱紅大柱上。聯云：“官須呵出，干來若處處瞻顧因循，縱免刑章終造孽；民要持平，看去使個個流離顛沛，忍將膏血入私囊。”丁雨生主政江蘇兩年多時間，勵精圖治，僅清理積案就達27萬多宗。朝廷為之詔示各省，以丁雨生為勤政榜樣。
事實上，林義哲和丁雨生的交集，很早就開始了，盡管二人并未謀面。
二人的第一次交集，是在天津教案期間。津案發生后，朝廷諭示直隸總督曾伯函辦理。但是法國方面獅子大開口，以至案件遷延不決。朝廷諭令丁雨生星速赴津，幫同辦理。丁雨生于七月二十五日到達天津后，進行了深入調查，在同法國方面交涉時，丁雨生一再指出法國駐天津領事豐大業開槍致使民情激憤，要求法國方面逮捕豐大業治罪；至于焚毀教堂等建筑及誤傷辜，亦屬事出有因，除嚴辦下手之人外，損毀建筑由總理衙門與各國協商賠款，誤傷者后事由大乾協助辦理。法國公使等在確鑿的人證物證面前，可奈何，法國皇帝拿破侖三世得知后下令逮捕了豐大業。天津教案后來在林義哲的暗中斡旋下得以順利解決，而在教案交涉期間，曾伯函心力交瘁，都是由丁雨生出面交涉，教案的解決，丁雨生其實也是出了不少力的。
在天津教案順利了結后，丁雨生深深的感到，積弱的中土，欲圖強盛，必須把造就人才作為第一要務。逗留天津期間，多次向曾伯函進言，鼓動曾伯函上奏朝廷派遣學生公費出國留學，得到了曾伯函的贊同。加之林義哲和李紹泉的助推，曾伯函的力奏得到了朝廷的允準，外派官學生留學終于得以實現。是為二人第二次交集。
彤郅九年，丁雨生經深思熟慮后，上《條議海防》奏折，提出《海洋水師章程》，建議設立北洋、東洋、南洋水師，大力鼓吹洋務，深得朝廷嘉許，所提建議多為采納實施。但如此一來，丁雨生卻受到了保守頑固派的忌恨，雖然他能力出眾，清正廉明，勤政愛民，但卻被清流黨罵為“鬼奴”，每當朝廷要升他的官時，總會有人跳出來阻撓，象這一次他本來是要由江蘇巡撫轉為福建巡撫兼總理船政大臣的，但因為清流黨參劾他“結黨營私”，結果只以巡撫銜擔任了總理船政大臣。
“他們越是提這夷夏之防，我便越是要破了他們這個身之根本，為洋務之興掃平道路。”林義哲道，“那些奸佞宵小，自有收拾他們的人，雨生兄不必理會。我等實心任事，干出一番經天緯地的事業出來，愧于天地良心即可。”
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