這幾年，杜森一直沒有停止活動，他身邊已經聚集了不少新人類,成為一個獨立于人類之外的組織。
這一切,自然引起了李昂等人的注意，做為一個不穩定因素，李昂等人決定消除他，派出了兩個軍團的戰力。不過，為了他們依舊給杜森一個回頭的機會，洛麗在魏思勒、喬、洛克的陪同下，來到南十字星防線外的基地。
雙方沒有直接會面，而是通過在通訊系統上見面，看到杜森，洛麗劈頭質問道：“杜森，你究竟想要干什么？”
“大姐，這不是很明顯的事情嗎？你應該很清楚我的想法。”杜森笑道。
“為什么你那么固執，在這種時期，你認為你能獨善其身嗎？回頭吧，還有機會的。”洛麗勸說道。
杜森搖了搖頭，道：“大姐，就算是戰死，我也不會屈服的。況且，誰勝誰負還不一定。”
“就你這點人，也想叛變？你和你的屬下已經被包圍，無處可逃。”魏思勒不屑地說道。
杜森失笑，道：“小朋友，我都不知道該怎么給你說，還是算了吧！我的幫手可是很多的，你看，它們來了！”
虛空中，出現一個個空間通道，一只只巨大可怖的高階蟲族出現，襲向人類軍團。
“杜森……你這個人類的叛徒，竟然與蟲族勾結！”突然間的變化讓魏思勒幾乎難以置信，他怒視杜森。
“不、不、不，我從來不認為自己是一個人類，另外。說勾結太難聽了，它們可是我忠實的盟友，比起人類，我更相信它們。”
“杜森。怎么會這樣？”洛麗不解地望著杜森。
杜森并不解釋。道：“我只是做出正確地選擇而已。為了新人類地未來。大姐。你還是離開吧！”說完。關閉了通訊。
基地外地戰斗完全是一面倒。面對這樣強大地蟲族。魏思勒手里那兩個軍團在蟲群地沖擊下。毫無還手之力。一觸即潰。目睹這一切。杜森掩飾不住雙眼地興奮。道：“真是一群可憐地家伙。沒有機會地。一切都在別人地掌控中！”
杜森大笑著。把多年積郁發泄一空。突然間。他覺得有些空虛。有了壓倒性地力量。對付人類。他覺得有些乏味。他開始想一些其他地問題。比如。今后該走什么樣地道路……
杜森率領少量新人類叛變。只是一個小小地插曲。北銀河人類與蟲族地戰爭依舊如火如荼。
對于智慧型高階蟲族來說。這場戰爭是對它們地試練。戰爭地較量不再只是在力量地較量。還包括戰略戰術等諸多因素。它們不斷學習著對于人類世界地將軍們來說。這場戰爭卻關系著人類地生死存亡。他們盡自己地最大努力對抗蟲族地侵襲。戰爭中。人類統一帶來地好處體現出來。就算人類地力量在上次戰爭時折損不少。如今集合所有力量。人類地戰力依然可觀。
陸南南做為領袖的帝國女皇，這時候成為了所有人的精神支柱，鼓勵人們成為了她主要的工作，不得不承認，她做得很出色。
一批批熱血青年走上前線，在楊威利、李昂、格雷斯等將領的出謀劃策下，很打了幾次勝仗，可是。蟲族的攻勢不但沒有減弱。反而更加兇猛。
人類陷入戰爭的漩渦，這場戰爭將持續下去。仿佛永無止盡。
對于這種狀況，智慧機械人地女皇阿姆樂見其成，按照她的原話來說，看著人類在戰爭帶來的災難中掙扎，可比直接消滅他們還要解氣。
若是沒有意外，人類可能會這么一直跟蟲族耗下去，直到耗盡所有戰爭的能力。不過，凡事總是有意料之外的狀況出現，一艘機動戰艦自南銀河返回，改變了戰爭的走向。
弗蕾雅號可以說是人類最先進地機動戰艦，在歷次戰爭中，戰功赫赫。這一次，弗蕾雅號承擔了探察蟲族母巢的任務，由于蟲族表現出來的戰爭能力，卡繆、蘭斯頓、楊威利等統帥一致認為，要想結束這場戰爭，必須從根本上解決問題，那就是找到蟲族的母巢，然后集中所有力量放手一搏，以求一戰而勝。
人類一共派出了一百多艘機動戰艦，沒有一艘找到母巢，多數在中途就給消滅。當然，弗蕾雅號也未完成這個任務，因為，這個任務根本沒有成功的可能性。由于艦長唐恩將軍的決策，它自中途返回，不過，沒有人去責怪，因為弗蕾雅號帶回的影像資料，讓他們對蟲族有了全新的認識。
在南銀河某處的虛空中，圍繞一艘巨大無比地堡壘，周圍是一艘艘蟲族戰艦，還有更多從未見過地可怕的蟲族……這個影像不止一個，弗蕾雅號一共發現了兩個這樣地群體，按照唐恩艦長的推測，這兩個集群應該只是蟲族的一小部分。
華恒星系的會議室，匯聚人類幾乎所有最高將領，一片沉寂，每一個人都感到絕望，都開始懷疑人類是否能贏得這場戰爭。
“明明有更加強大的戰力，卻只派出很少的一部分，這意味著什么？”楊威利苦笑著，無可奈何地道：“我感覺我們被愚弄了！”
“這些該死的蟲子究竟想要干什么？”李昂怒道，焦躁的情緒讓他幾乎失控。
楊威利想了想，道：“完美或許確實給愚弄了，我們一直認為蟲族的智慧不高，可是，現在看來，它們比我們聰明得多。從對幾場戰役的分析來看，它們在學習我們的戰略、戰術……”
“楊，你說得是真的？”蘭斯頓面色難看。
“我倒希望是假地，但這是我目前唯一能想到的。為什么它們有那樣強大的戰力，卻和我們打這種過家家似的仗。如果蟲族的目的真的是這樣，一旦到了沒有值得學習的東西那一天，將會是人類的末日。”
“沒有辦法嗎？”梅凱爾問道。
楊威利搖頭，“完全沒有，在壓倒性地力量前，戰術并沒有意義。除非……”
“除非什么？”巴德哈急切地問道。
“除非我們能借助外部的力量。”
“外部的力量，？”梅凱爾唯一能夠想到的就是
楊威利否定了梅凱爾地想法，道：“……從杜森叛變這件事情看來。他與蟲族達成盟友關系，費平在其中應該起著重要的作用，由此，不難想像與蟲族的關系。至少不會是敵對的，他們也沒有理由幫助我們。”
“但是，它們也沒有攻擊我們，不是嗎？或許，我們可以跟它們好好談談，蟲族這么強大，沒有道理它們會沒有顧忌。如果知道它們的確切位置，我可以擔任使節，我去說服它們，就算付出一些代價，只要能挽救人類，一切都值得。”巴德哈堅定地道，若是知道的總部位置，他恐怕會立即出發。
楊威利嘆了一口氣，思索著道：“政治這種東西可能并不適用于它們。我不贊同你的想法，不確定地因素實在太多，人類的未來還是只能靠我們自己。至于，它們為什么不攻擊我們，我覺得，最大的可能是不屑吧。”
格雷斯起身道：“對。不能奢望別人的施舍，我們還有最后的手段！”
“你的意思是……”所有人的目光集中到格雷斯身上。
“對，我建議動用戰略級武器，不過想要發揮效力，恐怕需要犧牲少部分的士兵。”
人類也有自己的終極兵器，那就是戰略級核武器，最大量級地戰略及核武器，可以輕易炸毀行星。核武器爆炸釋放的能量，雖然不是屬性能量。但也是達到原子級別的能量。自然能給蟲族造成巨大的殺傷。
在格雷斯的建議下，人類軍隊選拔志愿者組成敢死隊。攜帶戰略級武器沖向蟲群，可惜，這次的計劃同樣遭遇了意想不到地狀況，蟲族事先知道了一般，戰略武器根本無法發揮效用。
接到這樣的報告，軍方召開又一次軍事會議，格雷斯面色陰沉地道：“我可以確信，我們內部有叛徒或者間諜。”
“格雷斯的推斷沒有錯，而這所謂的間諜，最大可能就是來自于，我現在更確信與蟲族建立了某種盟友關系。所以我把調查目標放到了身上，然后，我發現了一個非常有意思的東西。”
“什么東西？”眾人都好奇。
“一段程序，一段可以控制整個世界的程序。”楊威利提高聲音道。
“楊，一段程序就可以控制整個世界，太夸張了，你究竟是什么意思？”蘭斯頓問道。
“聽我說完，你們就知道我的話是否夸張了，各位有沒有想過，如果我們每天使用的電腦背叛我們的話。”楊威利努力引導眾人地思路。
事情太奇異，眾人地腦子一時間沒有轉過彎，楊威利直接說道：“我發現的這段程序，能夠讓電腦擁有更高地智能，大大提升使用效力，想必大多數人都享受這段程序帶來的方便。”
頓了頓，給眾人一些反應時間，他繼續道：“可是，它正是流傳，他們愿意給出這樣方便的東西，說它是惡魔的禮物也不過分，從一開始就有其目的。通過專家研究表明，這段程序具有病毒一般的特性，可以不斷復制傳播，構建一個巨大的網絡，通過這個網絡，確實可以掌控整個人類世界。”
在場眾人都知道楊威利的判斷一向精準，盡管這次的推斷有些匪夷所思，大家還是相信了大半。想到所有電腦都在別人的控制中，人類的一切都在別人的監控中，卡繆元帥等人后背都是一陣陰冷，電腦已經成為人類生活中必不可少的一部分，簡直有些無法想像沒有電腦，生活怎么過。就算此時此刻，在這個會議室，也在電腦的監控之下。
“關掉所有的電腦！”李昂突然道。
“該死的，直接關掉電源！”格雷斯大叫。
“我已經清除了這段程序，大家暫時可以放心。”
會議室中一陣混亂，楊威利說出這段話，所有人才冷靜下來，剛的反應確實都有些神經過敏。但是，他們仍舊不得不解決一個難題，怎么讓電腦不背叛人類？
“清除這段程序，需要很長時間，而且不一定能完全清除。”
“不完全清除，我們的一切計劃都落在他們的眼里，仗還怎么打？可是，沒有它，我們軍隊中的許多兵器，尤其是機甲的戰力會減弱不少。”
商討無果，會議室陷入死寂，良久，格雷斯說道：“或許有一個辦法，可以試試。”“什么辦法？”
格雷斯有些猶豫，最后還是道：“我們三千紀聯盟曾經有一個研究項目，關于人機一體的研究，由此衍生出一套系統，本來這套系統是那些高層，為他們生命快要盡頭的時候準備的，我覺得可以試試，或許可以解決目前的困境。”
“究竟是什么樣的系統，格雷斯你說詳細點。”卡繆元帥道。
格雷斯點了點頭，道：“這套系統稱之為圣賢系統
在格雷斯的解說下，眾人明白了這套圣賢系統究竟是怎么樣的，圣賢系統最初的目的是勇于電子戰，因為電腦系統總是會被破解的危險，所以，三千紀聯盟的科學家想到一個極端的辦法，采用人機一體，利用人類的大腦與智能系統結合的方法，生成一套有自我意識的智能系統。
圣賢系統的研究得到三千紀聯盟高層的支持，他們多數是一些老人，也是人類各個領域的頂尖人物，以人類的壽命，他們的生命已經沒有多少時間。所以，他們很愿意利用自己的大腦構建這套系統，希望這個系統如同就如古代的賢者一般，指引人類未來的道路，是以，他們將這個系統命名為“圣賢系統”。
會議室中眾人沉默許久，對于三千紀聯盟那些高層的事跡，眾人感到深深的震撼，但，更多的還是遺憾。三千紀聯盟高層一直隱藏在幕后，他們不愿意留下自己的名字，一心為人類的將來默默謀劃，可惜壯志未酬，死于非命，令人扼腕嘆息。
現在回想起來實在有些可笑，在座的各位將軍，當初多數都站在三千紀聯盟的對立面，一種負罪感在內心蔓延。
卡繆元帥起立，含淚道：“我們不得不為這樣偉大的情操折服，即便，他們已經逝去，死在敵人的陰謀之下，我不得不承認我是一個罪人，死千百次也不足惜。不過，我還是要活下去，不是為了我自己，而是為了繼承他們的遺志，守護人類！”卡繆元帥握緊拳頭，說出了自己的誓言.。
“守護人類！”所有人起立宣誓。
會議結束后，所有人分頭行動，格雷斯前往三千紀聯盟的某個基地準備，其他人著手尋找各個領域符合條件，又愿意捐獻大腦志愿者。一個月后，也就是新歷2074年二月，人類第一個“圣賢系統”成功啟動。