搞定了建奴之后，朱慈烺最終要的事情就是軍事改革了。
軍事改革第一步，自然是對新軍系統進行從新梳理。
想要修理人家，肯定要先把自己搞明白。
吸收了這次對建奴作戰的教訓，朱慈烺打算對原本的新軍進行整編。
所有的總兵都改為師，指揮使改為旅，千戶改為團。
而一個小旗十人編制，總旗五十人，這個相當于班排，這個不用動。
但是一個百戶統管兩個總旗就有點不夠用了，按照新軍的作戰理念，若是一個百戶為最基本作戰單位的話，一百人就太單薄了。
就像是這次趙安東部的作戰，千戶級轉為百戶級防御之后，每一個百戶所的密度都不足以抵御建奴騎兵的沖擊，所以才導致迅速被擊潰。
所以新的總旗之上，朱慈烺加入營級作戰單位，五個總旗，也就是二百五十人的火槍手，再加上一個炮兵總旗五十人，一個斥候總旗三十人，后勤總旗五十人，醫療總旗二十人，營部人員五十人。
滿編的一個營兵力達到近五百人。
以后營這個單位，就是明軍最小的單獨作戰單位，編制的目的就是能夠承擔獨立的作戰任務。
所以在武器上，不僅有火槍手，也有炮兵、騎兵甚至輜重醫療都有配備。
單獨的作戰任務例如，一支數百人的盜匪，一個反抗者的堡壘，一個不服從王化的部落等等。
考慮到作戰的需要，朱慈烺并沒有全部照抄后世的編制，至少大明新編制里面就沒有排這個編制。
營級之上就是團了。比起千戶所，大明團這個編制就大的多了。
首先五個常規營，使得整個團的火槍手達到一千二百五十人，一個單獨炮兵營，五百人，一個騎兵營三百人。
再加上輜重后勤等等，每個團的人數就達到了五千人，基本等同于衛所。
到了團級單位，基本就能在一場戰役中控制一個戰場方向，或者一次低烈度的戰斗。
例如一次縣城爭奪戰，或者對付五千人以下的建奴，萬人左右的叛軍流寇等等。
團級上面就是師和旅，師跟旅并不是上下級關系，而是并列的。
根據戰場的強度，敵軍的數量，戰場的復雜程度，總參謀會考慮派出一個師或者一個旅出站。
一個旅往往只有兩個到三個團，足夠因對三萬人以下的叛亂，或者一萬人的建奴，五萬人左右的流寇。
而師一級往往都是五個以上的團，朱慈烺的要求就是以一個師的兵力，足夠滅掉一個小型國家。
一個師動輒三萬人以上，以現在的建奴規模，單獨一個師的兵力，就足以對抗建奴全部兵力。
可以說，一旦整編完成，那么再對付建奴，就輕松多了。
因為軍事改革之后，部隊平時訓練、防守、輜重、后勤等事務都歸參謀部管轄。
而各級主官只有接到總參謀部的軍令，核對虎符之后才能接管指揮權。
所以雖然師的規模膨脹了很多，但是并不擔心有人因此生出不軌之心。
而且師級平時并不會配屬騎兵和炮兵團，平時駐扎的時候，輜重和后勤等也都是總參各部直管。
所以即使有人生出不軌之心，在沒有重武器，沒有騎兵的情況下，威脅也降低了很多。
像火炮這種東西，也只有團級才有攻城重炮、大型野戰炮、還有大型攻城器械配置。
沒有配屬炮兵團的師是沒有攻城能力的在野戰中，也不如擁有重炮的師。
炮兵團除了野戰炮團、攻城炮團之外，還有專門的岸炮團和叢林戰炮團、戰略重炮團。
而騎兵又是另一種編制方法。
因為這一戰之后，建奴已經無力攻打河套，即使面臨威脅，駐扎一個旅也足夠防守。
所以再在河套駐扎大量騎兵，就變得沒有必要了。
而且把大明所有的騎兵都置于曹文詔之手，就算他沒有謀逆之心，那難免也會驕橫。
所以這次改革騎兵將會進行分拆。
騎兵有其作戰的特殊性，速度是騎兵的根本，所以對于那些大炮類的并沒有編入。
三人一個小旗，三十人一個總旗，一個騎兵營三百人，一個團的騎兵三千人。
到了這里就不再往上編制了，而是根據戰爭需要，派出不同數量的騎兵團配合作戰。
而師以上就不再常設職位了，如果一場戰役需要出動一個以上的師，皇上就會登壇拜將。
基本上兩個師以上就是滅高麗、越南、倭國這樣的中型國家了。
以目前的情勢來看，這樣的編制足夠十年到二十年內使用，當然如果不夠，那到時候再調整就是了。
在新軍編組之前，首先要編組的就是錦衣衛大漢將軍，這些人一直護衛皇宮核心安全，代表著大明的臉面。
按理說他們應該是大明戰斗力最強，最能打的一支軍隊，精銳中的精銳。
但是事實上，這些人空有花架子，根本就沒有打過仗，不要說打仗，打架都打不贏新軍的任何一支。
大明皇宮護衛體系太祖時有十二衛，永樂朝增設十衛，宣德朝又增設四衛。合計為二十六衛。
這些衛有大有小，組要分為兵和儀仗兩部分，而崇禎之后為了編練勇士營，沒少從這些衛抽調人手。
后來編練勇士營新軍，更是把人員抽調一空，以至于這些衛很多都有名無實。
皇宮防御，這個可是崇禎的禁臠，朱慈烺只是建議從新編組，從建京師和皇宮防御體系。
經過跟崇禎商議，京城及皇城將成立三個師為基礎的防御體系，即勇士營、神機營和京營第一軍。
三個師輪流護衛皇宮和京師安全，總兵力約十二萬。
勇士營和神機營因為功勛卓著，所以名號得意保留，考慮到京營的特殊地位，崇禎特意允許京營第一批改組的那個軍也保留。
這三個師被命名為禁衛軍第一、第二、第三師。
三個師各保留一萬人的新軍，然后從內二十四衛和京營招募人員擴編而成。
而分出去的三萬人則分成三份，分別駐扎昌平順義方向，通州方向，房山方向，然后吸收剩余的京營及衛所兵力組建大明第十一、十二、十三師。