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但是任超卻沒有就此放過這些各地督撫的念頭，在收復了菲律賓，閩浙和兩廣四省之后，時間又過去了大半年，這時候已經到了1898年的9月份，這例行御前會議上，任超上奏光緒帝，彈劾陜甘總督升允，貪贓枉法，賣官鬻爵，縱兵劫掠等十項大罪，要求將升允革職拿問，械送京師交由司法部審訊議罪。**樂**讀**小說.２３.并向光緒帝及內閣大臣們出示了升允收受賄賂的一干罪證。任超同時提議新疆巡撫饒應祺數年來治理新疆有功，可擢升為陜甘總督。
同時任超彈劾云貴總督崧藩與叛逆原兩廣總督德壽暗中勾結，意圖謀反，并公示了在兩廣總督府里搜出了德壽與崧藩暗中來往的書信數十封，其中多有大逆不道之言，要求嚴懲崧藩以儆效尤。
但是任超此舉遭到了李鴻章等內閣大臣的強烈反對，雖然任超證據確鑿，但是李鴻章等人卻以事關重大為由，主張應由皇上派出欽差大臣前往云貴和陜甘查訪此事，待事情查明，如果屬實再做處置。
光緒帝自然是采納了李鴻章等人的建議，分別派出欽差大臣前往陜甘和云貴查訪。任超雖然有些不高興，但是也沒有表現出來，只能默默接受了這一現實，但是任超并沒有就此放棄。
李鴻章等人此舉不過就是緩兵之計而已，以防止任超的勢力進一步的膨脹，所以雖然光緒帝指派了欽差大臣，但是欽差大臣遲遲沒有上路，一直拖延了數天。
而這幾天時間里，任超卻沒有閑著，一直在暗中調兵遣將。就在欽差大臣正準備上路的時候，任超突然以陸軍部的名義發布命令，以加強邊防力量為主，命令駐守廣西境內的兩個師。分別向云南和貴州挺進。命令寧夏的牛凱旋，派騎兵第二師及步兵一個旅向新疆挺進，另外派出步兵一個旅進入陜西，同時駐守山西的第八師也接到命令分兵數路向陜西進軍。
任超此舉極大的刺激了各地方實力派，云貴總督崧藩，陜甘總督升允，四川總督恭壽這三位滿清總督發表聯名通電，討伐叛逆任超。但是這也只不過是失敗前最后的叫囂罷了。
在陜西牛凱旋率領大軍，一路勢如破足，僅用了三天時間便兵臨西安城下。不到半天時間便攻破了西安城。陜甘總督升允化妝潛逃，僥幸逃過一劫。逃出西安之后連夜逃往了蘭州，但是虎賁軍兩萬大軍隨即追到了蘭州，于10月中旬攻占蘭州，允化畏罪自殺。截止到11月中旬，虎賁各部成功控制了陜西，甘肅，新疆三省。
在南線，虎賁軍的進展也是相當順利。10月19日便成功攻占了貴陽，11月8日成功攻占昆明，崧藩逃往越南。但是越南的法國殖民當局根本不敢收留崧藩，經過一番交涉之后。于12月初法國殖民當局乖乖的將崧藩交給了虎賁軍。
叛亂發生之后，任超隨即命令長江艦隊封鎖了長江航道，隨后護送東海艦隊海軍陸戰隊七千余人揚長江西進。兩江總督劉坤一和湖廣總督張之洞情知無力對抗虎賁軍，根本不敢加以阻攔。11月中旬。海軍陸戰隊成功攻占重慶，隨即向成都進軍，于此同時攻占云南和貴州的虎賁軍各出兵一部夾擊四川。12月初，虎賁軍成功攻占成都，四川總督恭壽被俘。至此西北西南各省叛亂基本被平定了。
1899年元旦，任超以陸軍部的名義發布命令，整編全**隊。此舉遭到了李鴻章等人的強烈反對，但是任超以憲法規定，陸軍部有權指揮全**隊為由，予以反駁，堅持對全**隊進行整編，強制收回各地督撫對個地方軍隊的指揮權。
此時各地督撫之中，只剩下了兩江總督劉坤一和湖廣總督張之洞。其中兩江總督本來下轄三個省，分別為安徽，江蘇，江西。而之前虎賁軍早已經控制了安徽省，隨后在接管南洋水師之后，組建了東海艦隊和長江艦隊兩支艦隊。這兩支艦隊下轄有海軍陸戰隊一個師又一個旅，共計兩萬余人，全部駐守在南京和上海附近的沿海沿江地區，也就是說江蘇省的大多數的主要城鎮其實都在虎賁軍的嚴密控制之下。何況在安徽，浙江，廣東等與兩江接壤的地區，虎賁軍還駐扎著整整六個師的陸軍。雖然劉坤一手中手握五萬南洋新軍，但是也不敢輕舉妄動。
而湖廣總督張之洞，雖然手里也有著三四萬新軍，但是此前虎賁軍一個所謂的工程部隊一萬多人已經以修筑京漢鐵路為由進入了湖北省，現在就駐扎在離武漢城不足百里之處，雖然說是一支工程部隊，但是張之洞心里卻清楚，那不過只是一個幌子罷了，這支部隊實際上卻是曾經參加過對日作戰，對俄作戰的虎賁軍精銳改編而成。何況湖南和湖北兩省，除了東面之后，此時也已經被虎賁軍三面包圍了。
面對如此形勢，張之洞和劉坤一只能乖乖的交出了指揮權，隨后虎賁軍成功進入江蘇，江西，湖北，湖南四省，順利接管了南洋新軍和湖廣新軍的指揮權。不進如此，任超還命令虎賁軍趁機接管了江南制造總局，漢陽兵工廠等主要的軍工企業。
為此李鴻章和任超大吵一架，年老體衰的李鴻章這個時候身體本來就已經不行了，因此大病一場，臥床不起，一怒之下竟然辭去了總理大臣之職務。
1899年3月任超奉命組建新內閣，首次擔任內閣總理大臣之職務，任超趁機將一些頑固派大臣全部擠出了內閣，將張之洞和劉坤一這兩位重臣全部調入了內閣，分別擔任內閣副總理大臣和民政部尚書的職務。但是即便如此，新成立的內閣也已經完全被任超所掌控了，雖然也有張之洞，劉坤一等人對任超形成一定的牽制，但是這些人也基本上是光桿司令一個，根本起不到決定性的作用。光緒帝雖然也不想看到這樣一個狀況，但是現在任超大權在握，各地方實力派也基本上被任超消滅殆盡，即便在各地督撫之中，仍有許多人對任超不滿，但是這些人沒有軍權，一切也是白搭，光緒帝對此也是無能為力。至此任超起碼在名義上完全了全國的統一。(未完待續。。)
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