甘卓率水路共五萬大軍進犯合肥、揚州兩地，其中他親率主力四萬人從水陸兩路進犯合肥。面對來勢洶洶的江東軍，淮南都督劉琨沉著應對，在重新整頓了一番巢湖水師之后，他利用水師再次重創江東。
本來劉琨麾下陸軍多而水師少，之前他曾一度放棄巢湖只憑合肥堅守，適逢江東水師大舉進攻合肥，結果被他用計讓江東數十艘戰船瞬間覆亡。這一戰不但讓江東更換了揚州刺史，更激的江東再次傾力來犯。
這一次江東傾力來犯，讓劉琨不得不先小心應對。劉琨最擔心的還是水戰，畢竟江東水師無論在兵力還是經驗上都占據著優勢，若不能打敗江東水師，合肥和揚州兩鎮將始終受到江東的威脅，同時沒有水師的協助想打下當涂也是妄想。
甘卓也是不甘寂寞之人，一到當涂之后，立即下令整兵準備剿滅朝廷的巢湖水師，奪回江東在水面上的優勢地位，當江東水師逆江而上時，巢湖水軍順江而下，水借風速，其勢如疾，出現在江東前軍斥候視野內。
發現長江上游突然漂來浩浩蕩蕩船隊，江東前軍兵斥候頓時相顧愕然：“難道是敵軍水師？”
甘卓正準備親自率軍攻擊劉琨，忽然聽說上游漂來無數戰船，眉頭頓時擰成一條條清晰可見溝壑：“以巢湖水師的實力他們怎么敢正面迎擊我江東水軍，難道劉琨將彭澤湖、高郵湖的水師調來了？難道我攻擊揚州的部隊沒有牽制住兩部水師？”
卻說，甘卓在江東本地士族的支持下才接任揚州刺史之位，執掌江北數萬水陸大軍，他之所以勒令全軍溯江而上，就是因為江東水師比巢湖水師強太多，為防備劉琨調集援兵插手巢湖之戰，他可是下令一萬多人攻擊淮南重鎮——揚州。
斥候也弄不清楚情況，遲疑片刻答道：“大人，來船高懸‘巢湖水師’旗幟，卻不知是真的巢湖水師，還是在假冒旗幟，虛張聲勢。”
聽完之后甘卓也猶豫了，疑惑道：“不該啊！我等來伐巢湖，曾遣密探探查淮南水師底細，巢湖水師雖然在前段時間重創了我江東，但他們絕沒有實力與我正面對決。可如今這么明目張膽的順江而下肯定有著不為人知的yin謀。”
未幾，斥候去而復返，回報甘卓：“啟稟大人，據部分士兵指認，來敵的確就是巢湖水師。”
“真是巢湖水師？”甘卓小愣片刻，自言自語道：“嘶，這巢湖水師真大膽啊！難道他們不知道我們江東水師主力全都出動了嗎？劉琨乃天下名士，他不會真以為憑借這些烏合之眾就能擊敗我江東水師吧？”
甘卓這么說是有道理的，別看巢湖水師剛剛打敗了江東水師，但江東上下依舊沒有將巢湖水師放在眼里。當初江東曾yu平鎮巢湖，可惜，江東當時雖然擊破了巢湖水師，但巢湖水師卻分散退至八百里蘆葦間，化整為零，并時不時偷襲江東水師，令江東水軍上下大感頭疼。
尤其，當時淮南陶侃勢強，江東無暇抽出余兵全力圍剿巢湖，誰知就是這樣一支沒有被江東上下放在眼里的水軍竟然慢慢成了氣候。因此江東水軍諸將對巢湖水師有些印象：巢湖水師正面作戰能力就是渣，但是他們比江東人悍勇善戰，精通小股流寇侵襲的作戰方式，巢湖水師常常借巢湖蘆葦，每次都令江東水師損失不小，乃至最后被迫放棄入據巢湖的心思。
所以甘卓一聽說是巢湖水師傾巢出動，他不得不懷疑對方的真實意圖，見主將誤解，斥候連忙解釋道：“大人，這支巢湖水師的實力比以前有了很大進步，其中巨艦比之前多了很多艘，實力不容小覷。”
甘卓這才恍然大悟：“原來是實力增強了，某說小小的巢湖水師怎么敢正面迎戰我江東水軍。前段時間溫羨刺史離任之時，曾叮囑本大人要小心北方朝廷的水師部隊。今我軍剛剛行至濡須口，務必小心謹慎戒備，不使敵軍有任何可趁之機。”
眾將答道：“謹遵大人之命！”
沉思一會，甘卓默默點點頭，又說道：“不管敵軍來意如何，我們先給他迎頭一擊，讓他曉得我們厲害。他若是來攔截我軍，那就先殺殺對方威風，不要覺得僥幸勝了一場就不知天高地厚，今ri本大人正好讓他們看清事實。”
知曉長江上游漂來數百戰艦，有些屬將憂心忡忡勸道：“大人，我軍乘勝而來，正士氣高昂之時，我軍猝然迎敵怕是難以戰勝，不若暫且避敵鋒芒，以逸待勞之后再與敵決戰？”
甘卓正意氣風發之際他怎能不戰而退，只見他大手一揮，表示不屑道：“巢湖水師怎能與江東水師相比？就算是對方得到了某些支援，然至今不過數十ri。諸位皆是帶兵之人，自然曉得要想將新部隊整合形成戰力需要耗費多久。巢湖水師雖然得巨艦數艘，然卻無異于六尺小二，舞弄百斤大刀，徒惹大人見笑，破之易如反掌爾。”
聞聽甘卓一番解說，其麾下諸將，頓時全部長長松口氣，再望巢湖水軍浩浩蕩蕩船只時，已將其視之為插標賣首之人。
于是，甘卓登船親督，無視巢湖水軍上游優勢，布三角攻擊陣型，以一百五十艘樓船居中，五百艘蒙沖、走舸分居兩側，其余六百余艘小船全部后置，靜等收割戰果。此次甘卓雖然號稱一千艘戰艦，其實只有一百五十艘樓船、三百艘走舸，其余盡是小漁船、貨船之類，不堪蒙沖沖襲。四百五十艘戰船，這就是甘卓所有軍力。
而巢湖水軍，不過三十二艘新式樓船、三十艘舊式樓船，樓船數目只是甘卓部水軍的一半，但是巢湖水軍卻又所轄蒙沖一百艘、走舸三百艘、游艇四百艘，依次涌入長江。單論船只數量，巢湖水軍實力，其實與甘卓水軍實力相差不大。
巢湖水軍順江而下，編隊作戰，前列是三百艘游艇，每艘游艇載櫓槳手三人，水兵一人，水兵手擎火炬，戰船后綴火船。三百艘游艇，分為四行，前兩行八十艘，后兩行七十艘，總體成棋形方陣。
其次是三十二艘新式樓船，兩側各分十六艘，齊列并行，每艘樓船前后左右，棱形集結二十艘走舸護衛。每艘樓船，上載九斤火炮六架，長弓手二十人，強弩手三十人，其他水兵四十人。
再次是一百艘蒙沖方陣團簇一起，橫列十艘，縱深十艘。蒙沖所載水兵，清一色人手一桿燧發火槍和一把手弩。
而后是三十艘舊式樓船，梅花狀布局，為中軍所在，樓船布局，與漢世標準樓船布局等同，這部分樓船都是當初俘虜的江東水師。
最后是百余艘走舸，清晰分為五列，彼此間隔大量水域。走舸半載水兵，或舉弩，或持橫刀，或長弓，或持長短兵刃。
其間，更有兩百艘游艇，滿載六名櫓槳手，傳令官兩人，奔馳戰場，傳遞將命，聯絡軍情。
巢湖大小近千艘戰船，綿延千數米，浩浩蕩蕩，碾向甘卓。
甘卓瞧見巢湖前軍為三百艘游艇和十二艘樓船，不禁哈哈大笑：“果然是濫竽充數，巢湖船只看似雖多，卻盡是游艇小船，不堪沖撞！傳我軍令，全軍靜伏，待敵船行至一百步內，再發起沖鋒，一舉聚殲來敵。”
隨著巢湖水軍漸行漸近，前軍斥候發現游艇所載水兵，竟然人人手擎火炬，立即向甘卓傳遞精訊：“巢湖水師或行火攻之計。”
甘卓處驚不亂，一邊吩咐后軍小船分散，一邊安撫諸校尉：“盡管我軍、有戰船數百艘，但長江水域寬敞，只要我等躲避靈活，不虞火攻。縱然巢湖水軍放來三千艘火船，也無損我軍兵威。”
水戰火攻，除非敵船靜止不動，否然，火攻之策，一般只能充作輔助，而不能倚為決定利器。當年赤壁之戰，東吳火攻之所以能建功，多是因為曹魏集結船只，鐵鎖攔江，難以躲避。正是因此，雖見巢湖水軍放船來攻，甘卓等江東出身的將領卻渾然不懼，坦然面對。
在甘卓看來，倘若巢湖火船較少，或避過，或搗沉，如此而已；倘若巢湖所放火船較多，他便順流而下，避入中江，然后掉頭再殺巢湖水軍回馬槍。畢竟，火船不可能應有盡有，遍布長江的火船，巢湖能積攢一批，卻不可能積攢第二批。
巢湖四行三百艘游艇，依次解開繩索，引燃火船，偏至江邊，掉頭逆行，為后軍讓路。
不過，三百艘火船雖然來勢洶洶，在甘卓眼中，卻只能勉強算是sāo擾：三百艘小型火船，分布在數千米寬闊江面，殺傷力極其有限。甘卓一邊穩住主軍，一邊傳達最新指令：“弓弩手預備，長兵器精戒，水手鎮靜不動，短兵器更換標鐵、長櫓，搗沉一切靠近火船。”(。)