雖然因為風暴無法出航，張煌言、鄭森以及安娜公主號上的全體海軍戰士可也沒閑著。要做的工作實在太多啦！
首先，是抓緊修復船體，尤其是重新安裝后桅。原來那根桅桿已經拋到海里去了，好在太平島上有高大的椰子樹，伐倒以后做桅桿正合適。至于其他部位的小修小補，就更不在話下，而這一切工作都是在風雨中進行的。
第二，是在太平島上設立工事。因為守島官兵并不多，不可能全面設防，只能在島嶼最高處設立炮臺，然后從礁盤上敲下礁石，打磨成石磚，圍著炮臺筑起一小圈圍墻。圍墻外再挖戰壕，戰壕內插滿削尖的木樁。雖然還是略嫌簡陋，但這座工事已經具備了防御的基本功能，缺乏火器的普通海盜若想強攻，肯定會付出慘重代價。當然這個工程量是非常大的，所以鄭森率領全艦官兵突擊趕工完成。等安娜公主號離開以后，守島官兵慢慢加固工事就可以了。
第三，則是日常訓練。雖然此次下南洋沒有戰斗任務，但鄭森謹記朱由檢的叮囑：要時刻繃緊打仗這根弦！因此即使每天的工作已經很累了，鄭森還是要抽出一個時辰，在戰艦和工事內進行各種演習。新加入的戰士過去沒有基礎，鄭森對他們更是嚴格要求，尤其是在軍紀方面，務求盡快去除過去的散漫習氣，盡快融入集體，形成戰斗力。
第四項工作同樣非常重要。每天夜晚收工后，張煌言和鄭森還要召集所有來過南海海域的戰士，大家憑記憶把南海的島礁標注在海圖上，然后再互相印證，最后得到一張比較可信的地圖。
當然，這份地圖的底子，也就是東南亞地區圖，是張煌言照著朱由檢給他的世界地圖謄畫下來的復制品。那份原圖可是最高機密，即使是鄭森，沒有旨意，張煌言都沒敢讓他看。可以說除了朱由檢之外，這個時空中第二個知道世界到底什么樣的人，也就是張煌言了。
經過幾夜努力，南海地圖終于制作完成了。西沙和南沙群島所有已知的島嶼、沙洲、暗礁和暗灘共有幾十個之多，除了具體位置以外，這些島礁的名字也都標注在了地圖上。當然，螺島和太平島因為實際抵達，安娜公主號上有租船時附送的六分儀，所以可以得出準確的經緯度。至于其他島嶼，尚需實地驗證，這將是一個漫長的過程。
除了這些正式工作以外，北海艦隊做為朱由檢親自組建的部隊，也和秦兵一樣，很重視官兵的思想工作。工作的間隙以及夜晚臨睡之前，張煌言、鄭森及各級軍官都會和普通戰士親切地拉家常。
其他戰士早已習慣了，剛入伍的新戰士剛開始時則有些受寵若驚，他們不敢相信官老爺會關心他們這樣最底層的人。直到幾天以后，他們發現北海艦隊內就是這樣關系融洽，將關心兵，兵愛戴將，這才敞開了心扉。
他們尤其愿意向張煌言訴苦，說到做蛋民時的艱辛和屈辱，講述者和傾聽者一齊流淚。而張煌言事后就把這些事情一五一十地記下來，準備回京以后面呈皇帝，因為這里面涉及到大量的地方官員貪腐不法行為。
七天之后，大海終于徹底恢復了平靜。安娜公主號搶修完畢，終于再次揚帆起錨，向正西方航行。這回在海上再沒遇到什么波折，僅用了不到三天時間，就抵達了此次出訪的第一個目的地：真臘。
由于有海圖指路，安娜公主號輕車熟路地繞過金甌角，折向北行，很快抵達了真臘國的港口城鎮磅遜。可是眾人向北一看，卻不禁大吃一驚：只聽緊靠大海的磅遜城內騰起數股黑色濃煙，并且隱隱傳來陣陣喊殺聲。這里怎么打仗了？
眾人正在觀察，忽見大批百姓扶老攜幼，跌跌撞撞地從城中向海邊逃來。后面則有一支約有數百人的步軍緊緊追趕，不分青紅皂白見人就殺，頃刻間已有數十人血濺當場。而海邊是一條死路，這些百姓眼看就要被屠殺殆盡！
將士們看得心頭火起，兩眼通紅，鄭森便請示張煌言道：“大人，這里并非我大明國土，這些人也并非我大明百姓，按理說他們打仗，我們不該干涉。但這些人如此屠殺手無寸鐵的百姓，實與禽獸無異！”
張煌言也氣得面色鐵青，強忍怒氣道：“不錯。而且真臘多次遣使入貢，其國王還曾得到我朝冊封，是我大明的藩屬國。如今發生戰亂，雖然情況不明，于情于理，我們也不可袖手旁觀。這樣吧，我們先制止軍隊屠殺百姓，問清始末緣由后，再做道理。”
鄭森就等張煌言這句話，聞命立即指揮戰艦靠岸，五十名全副武裝的海軍戰士立即下船，擺出戰斗陣型。于此同時，艦首主炮開炮示威，只聽轟隆一聲巨響，不論是逃跑的老百姓，還是后面的追兵，全都嚇得止住腳步。
這時張煌言也率領幾名翻譯下了船。真臘人通用高棉語，有一名翻譯上前拉住幾個驚慌失措的百姓，用不太嫻熟的高棉語詢問了幾句，趕緊回稟道：“大人，這些百姓都是真臘百姓，后面的軍隊卻是安南人。安南發兵攻打真臘，真臘不敵，磅遜已被攻陷了！”
張煌言大吃一驚，心道此番出使之前，自己也做足了功課，對南洋諸國略有了解。真臘和安南并不接壤，中間和隔了個占城國，怎么安南兵就打到真臘來了呢？
不過此時容不得張煌言細想，因為那支安南軍隊稍稍猶豫片刻之后，仗著自己人多，再次追了上來。張煌言與鄭森商量了一下，便率領部下迎上前去，讓過逃跑的真臘百姓，把安南人擋了下來。
安南軍倒也未敢輕舉妄動，在數十步外停下。一個指揮官模樣的人走上前來，嘰嘰嘎嘎地說了起來，語音腔調要多難聽有多難聽。鄭森不禁皺眉哂道：“這說的是什么鬼話？”
張煌言手下的一個翻譯卻聽出來，這正是安南人講的越語。張煌言當即領著翻譯上前交涉，義正辭嚴地道：“本官是奉大明皇帝圣旨，出使真臘等國的使臣。爾等既是安南人，因何攻打真臘，屠殺無辜百姓？”