處理完左良玉的事，秦牧神色一整，接著說道：“楊慎，開始吧。”
楊慎起身向秦牧一揖，然后朗聲說道：“如今天下戰爭頻發，為了應對即將到來的更高強度的戰爭，大人擬在軍方設立幾個部門，分別是總參謀部，總監察部，總裝備部，總后勤部。這幾個部門將分管我軍作戰、政治、裝備、和后勤等工作，直接向大人負責。
總參謀部將作為在秦大人的領導下，負責組織我軍建設和作戰指揮的最高軍事統率機關。根據大人初步構想，總參謀總將設置以下有司，分別為：作戰部，軍情部，軍訓部，裝備部，動員部，機要司，測繪司等部司，各司其職。”
三司廳的各人都凝神屏息聽著，暫時沒有人出聲。
楊慎接著說道：“接下來要說的是總參之下各部門的職能，首先是作戰部。作戰部將作為總參部的核心部門，全軍所有的軍事命令都將通過作戰部下達，是全軍戰時的總指揮部；軍情部主要負責搜集、分析軍政情報，其他部門的職能顧名思義相信大家也不難理解。”
“接下來要說的是總監察部，總監察部的職能是為奪取戰爭的勝利，保證軍隊的忠誠、以及大人的政策在軍隊中的貫徹落實，保證全軍在思想上與大人保持高度一致，保證軍隊政治合格和戰斗力的提高等。下轄組織部、宣傳部、保衛部、聯絡部、軍事檢察院、軍事法院等部門，將對千戶所以上的駐軍單位派出僉事。分管軍中的政治工作。”
“第三是總后勤部，主要負責全軍后勤組織指揮和勤務保障。下設財務部、軍需部、軍醫部、軍械部、車船部、物資部等部門，其他的大家大概好理解，在這里要著重說的是醫療部，軍醫部最要的職能是組織指揮醫護人員，戰時負責治療病患，搶救傷員。”
“最后是總裝備部，負責全軍武器裝備的研制、測試定型等工作。”
楊慎把幾個部門的情況大至介紹一番后，秦牧嚴肅地說道：“好了。在坐的各位請暢所欲言，有什么建議及問題可直接提出。”
司馬安一直皺著眉頭，秦牧話聲一落，他立即說道：“大人，歷朝歷代在統兵權和調兵權上，都會作出明確分割，分權于不同部門。這一點至關重要；
比如宋朝，統兵權掌握在三衙手上，三衙負責軍隊平日的駐防，訓練等事宜。而調兵權掌握在樞密院手中，一切軍隊調動，作戰事宜必須通過樞密院來進行；
再看大明。平日統兵權掌握在五軍都督府，調兵權掌握在兵部。五軍都督府平日掌兵，而無權調兵；兵部負責戰時調遣軍隊、指揮作戰，但平時無權掌兵；
從歷朝歷代的成例中，不難看出分割調兵權與統兵權的重要性。然而，大人設置的這個軍制。屬下看不出有對統兵權和調兵權的明確分割，這極為不妥。”
司馬安的話可謂是直指核心要害，為了保證軍隊不出問題，防止將領權力過大，在軍事體制方面，中國古代的體制甚至比后世的體制更完備，也更嚴厲。這種調兵權與統兵權的明確劃分就是最好的說明。
拿宋朝的軍制來說，平日統兵的將領，包括三衙的主官在內，若是沒有樞密院的調令而擅自調動軍隊，輕者解職，重者處斬。
明朝也基本沿用了這種調兵權和統兵權的劃分，而且更加嚴備，宋朝將全國的軍隊分統于三個衙門，而朱元璋則將全隊分統于五個都督府，這樣最高的統兵將領權力被劃分得更小。
這種劃分有效地防止了將領專權，威脅到皇帝統治地位。
秦牧當然知道劃分統兵權和調兵權的重要性。
但是，他也知道正是由于這種劃分，使將領受到了極大的牽制和約束，直接導致的結果是軍事上的反應遲緩，突發戰爭時，往往十分被動，容易錯過最佳的戰機。
就目前而言，秦牧手下只有十五萬軍隊，而且很快將面臨一系列高強度的戰爭，若是現在就對將領過多的牽制，使軍事體制過于硬化，對接下來的戰爭將極為不利。
正是考慮到這一點，秦牧在設置這套軍事體制時，才對統兵權和調兵權的劃分進行模糊處理。
要限制將領的權力，防止將領權專，還是等到整體戰局處于優勢，自己面對滿清大軍時掌握了戰爭主動權時再進行吧。
他現在成立總參謀部、總監察部、總后勤部、總裝備部這四個軍事部門，其意并不是要限制將領的權力，而是希望提高軍隊的作戰效率，保證重大戰役時作戰指揮、后勤供給更高效有序。
秦牧將自己的這層意思向司馬安約略點明之后，司馬安將其中的利弊反復衡量了一番，覺得若是總監察部派往軍事的僉事能發揮應有的作用的話，對防止將領變質也算是一道保險了。
另一方面，現在也不能算是全然沒有劃分統兵權和調兵權，實際上統兵權現在是分散在各個將領手上，而遇到重大戰役時，軍隊由總參謀部統一調度指揮，等就是總參掌握著調兵權。
只不過是在一些小規模的局部戰爭時，統兵將領受到總參的限制比較小，可以自由發揮而已。
加上現在軍隊人數還不算太多，各個統軍的將領單獨統領的軍隊人數也少，而且都是追隨秦牧一路走過來的，司馬安也沒有再強烈要求劃分統兵權和調兵權。
接下來，三司廳內所有人對四個軍事部門內部的職司進行了逐一的討論，幾乎人人都發言了，討論極為激烈；
論及總后勤部的職司劃分時反而是最困難的，因為后勤工作在眼下不單涉及到軍隊，還必須要有地方官員以及劉伯全這個“戶部尚書”的配合，它的職能最為復雜，涉及面也最廣。
光是軍方物質的采購、管理、運輸有沒有必要完全與地方官府脫離，另設后勤系統這些問題，大家就爭得面紅耳赤。
不少文官認為這樣會造成人力和財力的重大浪費，而軍方將領則大多支持成立的軍事物質供給系統，以提高戰爭物質的供給效率。
這事實際上涉及到文官和武將之間的權力分配問題。
連后勤供給都由軍方掌握之后，文官在軍事上更沒有話語權了，這與歷朝歷代多以文統武的慣例不符。
歷朝歷代也從未出現軍隊供給系統完全由軍方掌握的前例，所以在這件事上，在坐的文官反對是非常激烈的，而武將反駁得更加激烈。
最后還是秦牧乾綱獨斷，拍板通過。
還是那句話，現在一切以戰爭為中心，一切都要服從于戰爭，以保證能夠節節勝利。
輪到討論總監察部的問題時，在坐的武將幾乎都收聲了。
很簡單，總監察部的核心職能是要保證軍隊的忠誠，以及貫徹秦牧的意志，這些東西很敏感，哪個將領反對的話，別人難免會對你的忠誠度產生疑慮。
實際上以前大明的軍隊并非沒有這樣的職能，象大明各個衛所、千戶所中其實也有僉事、指揮都僉事一職，只是秦牧設定的僉事職能更齊全，實際就相當于后事軍隊中的政委，職權很大，可以肩軍中主將。
這場軍制體系的設定太復雜，秦牧雖然根據后世的認知設立得很完備，但并不是每一樣都適合當下的情況，每個部門的職能基本都需要重新討論，非一日便能落實下來。
而此時，在北方，李自成的大軍已經越過居庸關，向北京撲去.........